抄録
真核生物における遺伝子発現制御およびヘテロクロマチン形成には,ヒストンおよびDNAの化学修飾やsiRNAを介したエピジェネティックな機構が関与している.シロイヌナズナにおけるsiRNAを介したエピジェネティックな遺伝子抑制には, siRNA合成に関わるRDR2遺伝子, siRNAを介したDNAメチル化に関わるDRM1, DRM2, CMT3遺伝子, およびヒストン脱アセチル化酵素をコードするHDA6遺伝子が機能すると考えられている.
我々は, タイリングアレイを用いたゲノムワイドな発現解析により, hda6変異体において特異的に発現上昇が認められる遺伝子群を同定した. それら遺伝子群は, データベース上に公開されているsiRNAおよびDNAメチル化のマッピング領域と高度に重複していた. 一方, rdr2およびddc変異体(drm1,drm2,cmt3三重変異体)を用いた発現解析の結果から, RDR2やDDCにより制御される遺伝子群は, 予想に反してHDA6遺伝子による制御領域とは殆ど一致しないことが明らかとなった. 以上のことから, HDA6による遺伝子抑制は, RDR2やDDC経路に依存しない機構であることが示唆された.