抄録
ラン藻はCO2濃縮機構（CCM）を持っており、これによって外界から無機炭素（CO2/HCO3-）を効率的に取り込んで同化する。CCMの成分をコードする遺伝子群のうち、cmpオペロン、ndhF3オペロン、sbtAはCO2欠乏時に転写が活性化される。LysR型タンパク質であるCmpRはCO2欠乏のシグナルとして2-ホスホグリコール酸（2-PG）を感知してcmpオペロンの転写活性化に関与する因子であるが、最近CO2充足条件下でCmpRが2-PG非依存的にndhF3の転写開始点付近に結合して、ndhF3オペロンを抑制することが明らかになった。CmpR自身をコードする遺伝子（cmpR）もCO2充足条件下でCmpRによって抑制されており、その上流側の短い遺伝子間領域（70 bp）には、ndhF3上流の2-PG非依存的な結合領域と類似した配列が見いだされたので、ゲルシフトアッセイによって解析したところ、CmpRがこの領域に2-PG非依存的に結合することが確認された。さらに上流側ORFを含む領域をプローブとしたゲルシフトアッセイにより、第2のCmpR結合部位が検出され、その領域をcmpR翻訳開始点120 bp上流までの範囲にしぼりこんだ。この第2の結合部位は2-PG非依存的に結合するが、2-PGによって結合能は増加した。現在、上流側の結合配列を同定し、cmpRの自己制御機構の解明を進めている。
