種特異的なプライマーを用いたPCR法によるAlternaria属糸状菌の同定

抄録

ブロッコリー黒すす病の現地罹病株から分離されるAlternaria属糸状菌を遺伝子診断により迅速かつ省力的に同定するため，Alt a 1領域の塩基配列に着目して，Alternaria属糸状菌4種（A. japonica，A. brassicicola，A. brassicae，A. alternata）の識別が可能な種特異的プライマーを設計し，その特異性について検証した。

上記4種の基準菌株から抽出したDNAを用いてこのプライマーセットの特異性を評価したところ，この4種を特異的に検出できることが示された。

また，愛知県内のブロッコリー，キャベツから分離されたAlternaria属菌102株をこのプライマーセットを用いた遺伝子診断で同定したところ，形態観察による推定よりも高い精度で同定できた。