アンサンブル
Online ISSN : 1884-5088
Print ISSN : 1884-6750
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特集「グラフィックボードを用いた数値計算の高速化」
GPUを使った古典分子動力学シミュレーションの高速化
坂牧 隆司
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キーワード: 古典分子動力学シミュレーション, グラフィックカード, Particle Mesh Ewald 法, 高速フーリエ変換
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2012 年 14 巻 2 号 p. 76-80

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抄録
グラフィックカードを用いて古典分子動力学シミュレーションの高速化を行った．具体的にはLJ ポテンシャルと，Particle Mesh Ewald 法を用いた際の静電ポテンシャルの近距離成分と遠距離成分の計算を実装した．また，LJ ポテンシャルおよび静電ポテンシャルの近距離成分の計算においては，使用する変数の精度が計算結果に与える影響を調べた．
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© 2012 分子シミュレーション研究会
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