アンサンブル
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特集「京」
京コンピューター上での汎用MD ソフトMODYLAS の開発
安藤 嘉倫
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キーワード: MD ソフトウェア, 京コンピューター, 高並列計算, 高速多重極展開法
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2012 年 14 巻 3 号 p. 126-129

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抄録
ここ数年我々の研究グループは通称「次世代スパコンプロジェクト」に参画し現在稼働中の京コンピューター上での運用を前提とした汎用分子動力学シミュレーションソフトMODYLAS (Molecular Dynamics Simulation Software for Large Systems) の開発を行ってきた. 8 万台をこえる計算機ノードから構成された巨大システムにおいて高並列・高演算性能を実現するために試行錯誤した過程を述べる.
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© 2012 分子シミュレーション研究会
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