DNA と蛋白質の相互作用と自由エネルギー計算

米谷 佳晃

doi:10.11436/mssj.17.111

抄録

DNA に結合する蛋白質には，それぞれ固有の認識配列があり，細胞内に存在する膨大なDNA 塩基配列の中からその認識配列を見つけ出す．どのような過程を経て認識配列に到達するのであろうか．最近，我々は，ラックリプレッサー蛋白質がDNA から解離する過程の分子動力学シミュレーションを行い，その過程の構造変化と自由エネルギー変化を求めた．本稿では，この計算結果をもとに，DNA 塩基配列を探索中の蛋白質の様子について検証する．

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