特集「生体分子の相互作用」
アルケミカル自由エネルギー計算とIT創薬
2015 年 17 巻 2 号 p. 92-97
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2015 年 17 巻 2 号 p. 92-97
計算物理・計算化学的手法に基づいたシミュレーションによる創薬を実現するためには，標的分子に対するリガンド分子の”結合ポーズ予測”と”結合自由エネルギー予測”が最も重要な課題である．この自由エネルギー計算の有力な方法として，非物理的径路の熱力学的サイクルに基づくアルケミカル変換法がある．本稿では，アルケミカル径路に沿った標準結合自由エネルギー計算法の概要を紹介し，メタダイナミクスによるリガンド分子の結合ポーズ予測と組み合わせた計算結果を報告する．
