アンサンブル
Online ISSN : 1884-5088
Print ISSN : 1884-6750
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連載
分子系における遷移・反応レートの計算法について
II
藤崎 弘士
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キーワード: マルコフ状態モデル, 遷移行列, マイルストーン法, ボロノイ分割, 遷移パス理論, コミッター関 数, 平均第一通過時間
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2015 年 17 巻 3 号 p. 175-180

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抄録
前回に引き続き，化学反応や構造変化，リガンド結合などに関わる速度論 (kinetics) を記述する量である，レート (rate) を分子レベルで計算する手法について解説する．今回は最近よく用いられるようになってきている，マルコフ状態モデル (Markov state model) とマイルストーン (milestoning) 法について取り上げる.
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© 2015 分子シミュレーション研究会
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