解説
フラグメント分子軌道（FMO）法，ならびに散逸粒子動力学（DPD）シミュレーションとの連携
2020 年 89 巻 10 号 p. 566-572
詳細
2020 年 89 巻 10 号 p. 566-572
フラグメント分子軌道（FMO）法は，タンパク質やDNAなどの巨大分子系に適用可能な量子論的な計算手法の1つである．FMO計算からはフラグメント間の相互作用エネルギーが得られるため，対象系の解析ツールとしても利用できる．本稿ではまず，FMO法の概要について私たちが開発しているABINIT-MPプログラムに関連して述べ，ペプチドの固体表面への吸着モデルなどナノバイオテクノロジー分野での応用事例を示す．次に，散逸粒子動力学（DPD）シミュレーションの有効相互作用パラメータを一連のFMO計算によって算定するマルチスケール的なFMO-DPD法について述べ，脂質系への適用例などを示す．
