抄録
ニホンカワウソは環境省発行の第 4次レッドリスト（2012）で絶滅が宣言された．しかし，本種の分類学的位置づけは混乱したままである．本種は，大陸に現存するユーラシアカワウソ Lutra lutraと近縁種であることは複数の先行研究で認められているが，日本固有種 Lutra nipponかユーラシアカワウソの亜種なのか意見が分かれている．そのため，環境省のレッドリストで本州以南の個体群について Lutra lutra nipponと記載しているが科学的根拠があるわけではない．そこで我々研究グループは，神奈川県城ヶ島産のニホンカワウソ標本に残存していた筋組織から DNAを抽出し，ミトコンドリアDNAに基づいてカワウソ亜科と系統解析を試みた．標本サンプルから抽出した DNAは，薬品や長期保存による DNAの断片化とその量の減少が予想された．そこで，Multiplex PCR法により約 350-500塩基の断片を増幅し，ダイレクトシーケンシング法で配列を決定した．この方法でニホンカワウソの配列を 7,325塩基決定した．また，同じ方法でサハリン産ユーラシアカワウソと中国・重慶由来の飼育下繁殖ユーラシアカワウソのミトコンドリア DNA全長配列を決定した．決定したニホンカワウソ配列を，サハリン /中国 /韓国の 3地域のユーラシアカワウソの配列と ClastalW2.1でアライメントしたところ，ニホンカワウソに特徴的な塩基サイトがND1，co2，co3の 3つのアミノ酸コード領域で7塩基認められた．これらのニホンカワウソに特徴的な塩基サイトを含む配列データを系統樹推定に用いた．推定は RAxML ver.7.2.8プログラム上において進化モデル GTR+I+Gを用いておこない，ニホンカワウソとサハリン /中国 /韓国のユーラシアカワウソの系統類縁関係を評価した．
