水質指標生物の教育効果を調べるため，7つの大学で学生アンケートを実施した。高校までに指標生物による水質調査を行ったことのある学生は1～2割程度であった。指標生物は，現行課程では中学理科第二分野，旧課程（～2011）では高校基礎生物の教科書で扱われることが多かったが，調査を行ったことのある学生の7～8割は小学校で履修しており、テキストとしては自治体等が作成した副読本の役割が大きいと考えられた。水質指標生物の学習によって水質に対する正しい科学的理解を得た学生は少なく，その原因として小学校では履修学年が早すぎることと，指標生物に内在する論理的不備の問題が考えられた。「川の水を綺麗にするために有効なこと」を選択する問いでは，美化体験の有無によって選択内容はあまり変化しなかった。指標生物の学習体験の有無では、調査年により「無りん洗剤を使う」「水草を植える」「EM菌を撒く」の項目が増加し，その中には疑似科学であるものも含まれていた。以上の結果から，指標生物の学習は自然に親しみ，環境への興味を喚起するには有効であるが，水質の科学的な理解にはほとんど結びついていないことが明らかになった。以上を踏まえ，学校教育において指標生物を利用する場合に改善すべき点として，(1)水生動物相を水質と関連付ける場合，化学的水質検査も同時に実施する必要がある；(2)水質指標生物は小学校ではなく、中学または高校で教えるべきである；(3)学校教育において指標生物を教える場合、水質以外の環境要因も考慮することが必要である；(4)小学校では、水生生物は生物多様性と地域環境を理解するための教材とするべきである；の4点を挙げた。
