Chem-Bio Informatics Journal
Online ISSN : 1347-0442
Print ISSN : 1347-6297
ISSN-L : 1347-0442
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蛋白質の構造予測と安定化のための技術の検証
TIMバレル酵素の1つである乳酸酸化酵素を用いたケーススタディ-
山岸  良介八木 博隆古市  真木雄村瀬 匡石井  元水野  洋島田  次郎皆川  宏貴大西  楢平金子  寛生
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2009 年 9 巻 p. 62-74

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抄録
蛋白質の立体構造を実験的に解明することは、現在においても容易なことではない。従って、様々な構造予測法が開発され、それを用いた予測構造も数多く発表されている。また、その構造情報をもとに、rational designを行ったり、実験結果を解釈している研究例も多い。しかし、立体構造が解かれたあとに、自分たちが行ったこれらの結果を十分に検証している報告は少ない。そこで我々は、独自に開発したホモロジーモデリング法の精度を、予測モデルと最近解かれた結晶構造を比較し、検証した。さらに、我々が予測モデルの助けを借りて得ることができた耐熱性変異体を分析し、rational designは正しかったのか、耐熱化機構に関する解釈は正しかったのかについても検証を行った。ここでは、乳酸センサーへの利用が期待されている乳酸酸化酵素(LOX)を例に用いた。この酵素は、多くの重要な酵素が基本骨格として採用しているTIM バレル構造を有する。本研究を通じて得られたTIM バレル構造に有効なモデリング方法や耐熱化手法についても提案する。
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2009 Chem-Bio Informatics Society
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