海洋地殻内部の帯水層には，微生物圏が広がっていると考えられている。しかしながら，地殻内微生物生態系の全貌を把握するには至っていない。近年、南部マリアナトラフ熱水域において海底掘削が行われ、それらの掘削孔から熱水（<40C）を採取することに成功した．その熱水試料の16S rRNA遺伝子解析の結果，熱水試料中にZetaproteobacteriaに近縁な真正細菌が存在することがわかった．新たに設計したプローブを用いたFISH法によって，この分類群が，熱水試料中の全原核生物（約10^5 cells/ml）の最大32%を占めることが示された．Zetaproteobacteriaが鉄酸化菌を含む分類群であることを考えると，この分類群は海洋地殻内の鉄酸化に重要な役割を担っている可能性がある．
