分子動力学プログラムMXDORTO用可視化ソフトウェアMDVISの開発

抄録

酸化物のシミュレーションに有用である分子動力学(MD)シミュレーションプログラムMXDORTO用の結果を可視化するソフトワエアVisualizer for Molecular Dynamics Simulation (MDVIS)を開発した． MDVISは，メイン，データ，オペレーション，チャートの4つのフォームで構成されている．メインフォームには3次元コンピュータグラフィックス(3DCG)によりMDシミュレーションで記録されている原子座標を連続的に表示する． オペレーションフォームの設定により特定の場所のみを表示したり，周期境界条件を考慮した拡張ができる．さらに選択した原子の軌跡を表示させる機能や選択した2原子間の原子間距離を計算する機能を備えた．3DCGの画面に同期している温度，圧力，格子定数，密度，内部エネルギーなどのデータを数値で表示するデータフォームとシミュレーション時間全般での変化を表示させるチャートフォームを実装した．