Journal of Computer Chemistry, Japan
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分子動力学プログラムMXDORTO用可視化ソフトウェアMDVISの開発
大石 駿介大川 政志
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論文ID: 2015-0010

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抄録
酸化物のシミュレーションに有用である分子動力学(MD)シミュレーションプログラムMXDORTO用の結果を可視化するソフトワエアVisualizer for Molecular Dynamics Simulation (MDVIS)を開発した. MDVISは,メイン,データ,オペレーション,チャートの4つのフォームで構成されている.メインフォームには3次元コンピュータグラフィックス(3DCG)によりMDシミュレーションで記録されている原子座標を連続的に表示する. オペレーションフォームの設定により特定の場所のみを表示したり,周期境界条件を考慮した拡張ができる.さらに選択した原子の軌跡を表示させる機能や選択した2原子間の原子間距離を計算する機能を備えた.3DCGの画面に同期している温度,圧力,格子定数,密度,内部エネルギーなどのデータを数値で表示するデータフォームとシミュレーション時間全般での変化を表示させるチャートフォームを実装した.
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© 2015 日本コンピュータ化学会
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