ディープラーニングを用いたDNA配列の解析

抄録

本研究では、自己組織化マップを用いてDNA配列を画像化し、DNA配列の画像をディープラーニングに学習させることにより分類することを目的とした。DNA配列は生物ごとに特徴があり、DNA配列を分類することにより微生物群衆のDNA配列を解析し、新たな遺伝子酵素を発見することを目的とした、メタゲノム解析への応用を考えている。実験の方法としては、DNA配列のある文字の組み合わせの次に続く文字を、任意の数読み取り、それを合わせた組み合わせを入力データとして自己組織化マップに学習を行わせDNA配列の画像を取得した。この画像を、畳み込みニューラルネットワークに学習させることにより分類を行った。