高レベル放射性廃棄物の地層処分や地中熱利用等に関連して，地質環境の基礎データの収集・整理が進められている．近年の国際動向をみると微生物情報を収集していく必要性が認識されつつある一方，未だにその知見は限られている．深部地下水における微生物の基礎情報を他の水質情報と共にデータベース化していくためには，微生物解析手法を体系化し，データ集積を進める必要がある．本報は北海道幌延町浜里沿岸域に位置する大深度掘削井から採取した深部地下水を対象に行った微生物解析の結果と一度の採水で効率的に地下水中の微生物に関する基礎情報，すなわち微生物数，群集構造，活性，群集構成を評価する手順を示した．
