研究論文
沿岸域から単離した腸球菌のPFGE法による遺伝子型解析
2011 年 40 巻 3 号 p. 138-143
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2011 年 40 巻 3 号 p. 138-143
現在，沿岸域における公衆衛生や細菌学的な安全性を確保するために，ふん便汚染源追跡手法の開発が強く望まれている．我々は，先端的な分子生物学的遺伝子解析手法であるパルスフィールドゲル電気泳動（PFGE）法を水環境に適応させ，追跡手法としての確立を検討している．本研究では，ふん便指標細菌であるEnterococcus faeciumとEnterococcus farcalisを港湾域から単離・同定し，PFGE法による遺伝子型の解析を行った．PCR法と生化学性状試験を用いた腸球菌種同定試験において，E. faeciumとE. faecalisが，それぞれ40株と２株同定された．港湾域から高頻度で同定されたE. faecium株の40株を用いてPFGE法による遺伝子型の解析を行い，全９種類のPFGE型が得られた．これらのPFGE型を用いて系統樹を作成したところ，類似性レベル0.7において，７グループに分類され，港湾域から回収したE. faeciumはさまざまなPFGE型を示した．PFGE法によるE. faecium株の遺伝子型を解析することによって，水環境におけるふん便指標細菌の分類・特徴付けができた．
