空間的遺伝子発現解析を用いた精神・神経疾患研究の展望

抄録

空間的遺伝子発現解析（spatial transcriptomics）は，今年，つまり，2021年に，Method of the Yearに選ばれた解析技術である。単一細胞解析では，一細胞ごとにRNAシークエンスを行うのに対して，空間的遺伝子発現解析では，場所（空間）の情報と結びつけながら，RNAシークエンスを行う。ヒトの脳は大きく発達するため，空間的にも複雑な形状をもっている。このため，精神・神経疾患の研究において死後脳の解析を行う際にも，空間的な位置情報を保ちながら，遺伝子発現解析を行うことが望ましい。現在のところ，その代表的な手法は，10x Genomics社のVisiumと，nanoString社のGeoMX Digital Spatial Profiler（DSP）である。この両者を中心に，空間的遺伝子発現解析について概観する。