抄録
次世代シーケンサー（以下、NGS）データの解析は、大まかに①データ取得、②クオリティコントロール（以下、QC）、③アセンブルやマッピング、④数値解析の4 つのステップに分けられる。連載第5 回は、アセンブルやマッピングを紹介しつつ、QC の重要性に焦点を当てる。第4 回でインストールしたQC プログラムFaQCs（ver. 1.34）実行、およびFastQC（ver. 0.11.3）でのアダプター/ プライマー配列除去確認から始める。そして、アセンブルやマッピングの試行を通じて、QC で除去し切れていない、（本来トリムすべき）末端部分を発見した事例を紹介する。ウェブサイト（R で）塩基配列解析（URL: http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r_seq.html）中に本連載をまとめた項目（URL: http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r_seq.html#about_book_JSLAB）が存在する。ウェブ資料（以下、W）や関連ウェブサイトなどのリンク先を効率的に活用してほしい。
