リアルタイムRT-PCRを用いたメタン発酵状態の評価

抄録

より高効率なメタン発酵プロセスの確立を目指して、メタン産生に関与する遺伝子の発現に着目した微生物の発酵槽内での挙動の解析を試みた。発酵槽から採取したDNAにより16S rRNAをターゲットとするシーケンス解析により反応槽内微生物の同定を行った。得られた菌叢情報や文献からメタン生成に関与するmcrA gene遺伝子のプライマーセットを作成し、リアルタイムPCR法によるmcrA geneの定量法を検討した。文献から得たMethanoculles用のmcrA geneのプライマーセットを用いた場合、リアルタイムPCR法によるmcrA gene量の定量法が確立できた。Methanoculles用のmcrA geneのプライマーセットを用い、連続式のメタン発酵処理実験槽内のmcrA geneの発現量をリアルタイムRT-PCR法により定量した結果、メタン生成量は、mcrA gene発現量の増加に対して１～２日の時間差で増加する傾向にあると考えられた。