抄録
F-boxタンパク質はユビキチンシステムのE3の一つであるSCF複合体の構成タンパク質であり、ユビキチン化の標的タンパク質に対するレセプターをして働く。我々は、In Silico解析からシロイヌナズナゲノムに存在するF-boxタンパク質を568個予測している(Kuroda et al. 2002)。これまでに約20のF-boxタンパク質の生理的機能が報告されているが、予測した遺伝子の殆どが機能未知である。我々は、逆遺伝学的にF-boxタンパク質の機能解析を行っており、そのツールとして、TAIRの予測配列を基にしたORFセットの作成を試みた。
様々な組織由来のtotal RNAを用いたRT-PCRおよび完全長cDNAを鋳型にしたPCRによりORFの増幅を行い、塩基配列解析を行った。このORFセットは、1）完全長cDNA の報告がない遺伝子のORFを含む、（2）新規なスプライシングバリアントと考えられるORFを含む、（3）終止コドンを含まない、（4）GATEWAY対応の特徴を持つ。新規なORFについて、塩基配列、ドメイン構造、発現パターンについて解析した結果、スプライシングバリアント間でのドメイン構造の変化、新規なスプライシングタイプ（Li et al. 2006）に属するスプライシングバリアント、組織特異的スプライシングを行う遺伝子の存在が明らかになった。
