シアノバクテリアにおける遺伝子位置の大域連鎖解析

抄録

異なるゲノム間の遺伝子の隣接関係は、ゲノム再編成等によるゲノム進化の指標であるが、異なるゲノム間で遺伝子のオルソログ関係を同定する必要があるため、進化的に離れた種間の比較には適さなかった。この問題を回避するため我々はGclustサーバー ( http://gclust.c.u-tokyo.ac.jp ) によって推定されたゲノムセット間で保存された相同的遺伝子のカタログの内、シアノバクテリアに関するデータセットを用い、それらのゲノム上での遺伝子の距離関係について解析した。16種のシアノバクテリアに関する解析の結果、これらの生物種では保存された遺伝子の近接関係がモザイク状に保存されていることを、前回報告した。本発表では、ゲノム数をシアノバクテリア25種に拡張したデータセットを用い解析を行った結果を報告する。