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本データベースは、平成16年度に発足した特定領域研究「植物の環境適応戦略としてのオルガネラ分化」における植物オルガネラ研究の支援を目的として、運営、構築されている。既に、平成18年9月よりVersion 1として一般に公開している(http://www.nibb.ac.jp/organelles/)。
Version 1は、(1)可視化されたオルガネラの動態を収集したOrganellome database、(2)オルガネラ研究に有用なプロトコールを収集したFunctional analysis database、 および(3)外部へのデータベースやホームページへのリンク集から構成されている。本データベースに登録されているオルガネラの画像およびプロトコールは、全て植物研究者から提供していただいた実際の実験データおよび解析方法より構成されている。これまで、Version 1のインターフェースの改善を行い、また、登録データを増やして内容の充実を図ってきた。それとともに、現在は動画に対応したVersion 2の構築を行っている。このVersion 2も完成次第、一般に公開し、動画データを提供して頂くことによりデータベース内の情報を充実させ、植物オルガネラの動態を明らかにしていくための研究ツールとして広く活用されることを期待している。