MITEsのイネ染色体上における分布

抄録

イネ染色体DNAのライブラリーから、DNA型トランスポゾンであるMITEに属すると考えられる340bpからなる配列1A1660-1000を検出した。二次構造予測プログラムmfoldによって解析したところ、1A1660-1000は逆方向反復配列を持っていることが明らかとなった。このMITE様配列1A1660-1000はイネ全染色体にわたって存在し、その部位は合計11613箇所であった。MITEには1000以上のコピー数を持つものも多いが、1A1660-1000のようにコピー数の多いMITEの例は多くない。そこで1A1660-1000の、それぞれの染色体における存在部位を図示したところ、染色体ごとに分布の様子は異なっていた。すでに報告されているイネMITEについても同様に染色体における存在部位をプロットしたところ、それぞれのMITEで存在のパターンが異なることが観察された。これらについて報告する。