抄録
我々は、植物ゲノム比較データベースであるSALAD database（http://salad.dna.affrc.go.jp/salad/）を作成、公開してきた。SALAD databaseでは、進化において保存された連続アミノ酸配列（モチーフ）の組み合わせによりタンパク質を分類し、類似性を指標とした関係をビジュアルに表示することができる。最新のver.3では10種（イネ、ソルガム、シロイヌナズナ、グレープ、シダ、ヒメツリガネゴケ、緑藻（2）、紅藻、酵母）のデータの比較解析が可能である。このSALAD databaseは、マイクロアレイのデータの表示にSALAD on ARRAYsというビュワーを備えている。このビュワーは、Agilentアレイ解析での発現量を色の濃淡で表示し、ユーザーが注目する遺伝子とパラロガスな（もしくは類似性が高い）遺伝子間の発現比較が一画面で簡単に行えるという他のデータベースには無い特長をもつ。今回、グラフ作成機能、アレイセット選択機能、表示順序変更機能を追加したので、報告する。また、今回新たにAtGenExpress（Affymetrix）のシロイヌナズナの783公開マイクロアレイデータ（29実験）の追加表示を進めている。この表示にはAgilentとAffymetrixのプラットフォームの違いを検討する必要があり、現在、比較実験も含めて解析を進めている。
