二面角空間における蛋白質ダイナミクス

抄録

蛋白質の運動は，主に主鎖二面角の変化によってもたらされる．しかし，これまで蛋白質の構造揺らぎにおける二面角の共同的な運動の仕組みはよくわかっていなかった．本研究では，二面角間の二体相関のみで構造揺らぎを記述できる二面角系分散共分散行列を開発した．この行列を応答関数として用いた二面角系線形応答理論により，リガンド結合に伴う蛋白質構造変化を従来より高い精度で予測することが出来た．