粗視化 MD の強みを活かした高分子シミュレーション

―適用の可能性と現実系との対応のために―

抄録

分子動力学法を用いて高分子のダイナミクスを扱うには，空間・時間スケールの制約から全原子モデル（粒子が 1 つの原子を表現する）ではなく，粗視化モデル（粒子が原子団を表現する）が適用されることが多い．粗視化 MD シミュレーションの強みは，粗視化したことによる大きな規模の計算に適用できる点がその1つとして挙げられるが，逆に粗視化したために，現実との対応という観点から，粗視化粒子間のポテンシャルに問題点を残すこととなっている．本稿では，粗視化 MD の強み・弱みを踏まえた上でのシミュレーションの適用可能性について議論し，さらに現実系との対応を考える際の重要な点の1つとして，代表的なポテンシャルパラメータ推算方法を紹介する．