創薬現場においては，最も重要な指標の一つである標的蛋白質への結合親和性，すなわち低分子―蛋白質結合自由エネルギーをより高精度かつ高速に計算できる方法が切望されている．そこで，高精度かつ高速な「溶媒和」自由エネルギー計算法として知られているエネルギー表示法(Energy Representation 以下ER 法)を，「結合」自由エネルギー計算に応用した計算法Fragment ER 法を筆者及びその共同研究者とで考案したので，本計算法について，これまで結合自由エネルギー計算によく利用されている自由エネルギー摂動法(Free Energy Perturbation, FEP 法)に代表されるアルケミカル変換法と比較しながら，その概要について紹介する．
