メタボロミクス解析は，質量分析法をもちいて代謝物質の種類や量，変動などをオミクス解析する手法であり，オミクス解析の中で最も新しい分野として近年注目を集めている．本稿では，メタボロミクスで用いる質量分析法の基本原理として，2 つのイオン化法とその分離方法，クロマトグラフの違いにより特徴の異なる分析装置のうち，メタボロミクスで頻回に用いられている GC-MS，LC-MS，CE-MS の基本原理を紹介する．そして，サンプル収集，調製からデータ分析に至るまでのメタボロミクスのスキームを注意点と共に概説する．最後に，活用例として，保存方法の違いにおける移植用臓器の代謝についてメタボロミクスにて解析を行った実験例を紹介する．
