抄録
【目的】ヒトと同様にニホンザルでもミトコンドリアDNA（mtDNA）の非コード領域にふたつの可変域がある。滋賀全県の群れにつき，両可変域の多様性の違い，ハプロタイプの地理的分布の特徴を分析し，塩基置換にみられる分子進化の特徴とニホンザルの集団研究へのmtDNA標識の利用価値を検討した。
【方法】県内のニホンザル96群から当該群生まれの個体を採血し，DNA試料を調製した。PCRでmtDNAの非コード領域を増幅し，上流部可変域（HVR1）474-475塩基と下流部可変域（HVR2）412塩基をdirect sequencing 法で解読した。可変域による置換サイトの種類，割合，分布パターンを比べた。また，各群のハプロタイプを分類し，タイプの出現頻度，全県のタイプ多様性を可変域間で比べた。さらに，ハプロタイプの分子系統関係をクラスター分析で解析し，県内の系統地理関係が可変域間で相関するかを検討した。
【結果・考察】96群について，HVR1には18，HVR2には８のハプロタイプが区別できた。塩基配列の全体サイズが異なるタイプは少なく，HVR1で１塩基の欠失をひとつ検出したのみだった。置換サイト数はHVR1で34（7.16%）（塩基欠失サイトを含む），HVR2で14（3.40%）であった。これらの結果は，比較した配列ではHVR1がHVR2より可変性が高いことを示している。ハプロタイプから大別できたクラスターの構成には，両可変域で相関が認められた。県内の群れが示すmtDNAハプロタイプの系統地理的特徴にこの関係は反映されていた。いずれの可変域を標識にしても，mtDNAでは個体群が遺伝的に不連続な構造をもつことは明らかで，female philopatryを反映する結果と考えられた。一方，ハプロタイプを細分できたHVR1では，HVR2で検出できない群れの系統地理的関係が推定できた。
