タンパク質 c-Myb R2ドメインの高圧下におけるMDシミュレーション

抄録

水溶液中のタンパク質は生体機能発現のために、様々な構造間をゆらぐ熱平衡状態にあり、またそのゆらぎの主な要因はタンパク質内部にある空隙であると考えられる。そこで、本研究では野生型のタンパク質c-Myb R2ドメインに存在する内部キャビティを対象に、このキャビティを充填した変異体と野生型のミクロなダイナミクスを明らかにする目的で、高圧下における分子動力学シミュレーション(MD)を行った。