食品中の残留農薬分析において，ある農薬の定量値が正しいかどうかを確認するため，異なる機器を使用して定量値の確認を行うことがしばしばあるが，それぞれの機器の値が完全に一致することは珍しい．本研究では，食品毎にどの程度違いがあるかを比較するため，当研究室の日常検査法を用い，121成分，6種類（グレープフルーツ，ばれいしょ，パプリカ，キャベツ，ほうれんそう，玄米）の食品について，GC-MS/MSおよびLC-MS/MSそれぞれの機器で妥当性評価を実施し，その結果を主に真度に着目して比較した．その結果，GC-MS/MSでは，上述の食品において97，111，110，118，111，63成分が基準に適合した．一方LC-MS/MSでは，50，114，103，112，100，103成分が基準に適合した．これら両機器の結果の差は，主にマトリクス効果によるものだと考えられ，マトリクス効果の補正によりそれぞれの真度は近似した．しかし真度の一致度については食品試料による差が大きく，特に玄米ではマトリクス効果を補正しても両機器の真度の差は20％以上であった．
