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有機化合物の同位体比解析は堆積記録から水柱の環境変化や生態系の推移を理解するのに有用な手法である。特にアルカンやその生成源である脂肪酸は培養実験により炭素同位体比(δC)は炭素固定回路を、水素同位体比(δH)はエネルギー代謝を反映することが報告されている。ただし、実環境では培養系と異なり、複数の代謝及び基質が混合されるため、異なる環境間での比較や時系列変化による解釈が重要である。本研究では特に好気、微好気、嫌気的環境の異なる微生物生態系に注目し、それらの環境における微生物相解析と脂肪酸δC・δH分析を行い、各環境の微生物生態系で同位体比へ反映される代謝情報を明らかにすることを目的とした。結果より、これら同位体比が深度ごとに異なるので、その分別を解析することで、独立栄養及び従属栄養細菌の寄与について解析を行った。