奈良県から大阪府を流下する大和川はかつて日本国内では最も水質が汚染された河川とされていた。その大和川に対して2002年から2005年にかけて大阪市立自然史博物館が主体となり、河川水系調査プロジェクトY大和川編が実施され生物及び水質の調査が行われた。2023年に再始動したプロジェクトY大和川編においては、2000年初頭に報告された主要イオン成分の経年変動の他、新たに微量重金属(Al、Mn、Fe、Co、Ni、Cu、Zn、Cd、Pb)や土壌から河川に供給される腐植様物質(フミン酸、フルボ酸)を調査項目に加え、大和川水質の変化や現状について報告する。2000年初頭と2023~2024年の濃度比較においては、硝酸イオンとリン酸イオンは2023~2024年でほぼ全地点で濃度増加が認められた。硝酸イオンについては1995年以降下水処理場においてこれまではNH4として放流していたものがNO3として放流する方式に変えられた結果と考えられる。硫酸イオンはほとんどの採水点で濃度が減少していた。