地球微生物学とバイオインフォマティクス

抄録

地球上のあらゆる環境には多様で膨大な微生物が生息しており、その生態を解明することは、地球全体の物質循環や生態系を理解する上で重要である。そこで、微生物の分布や生理生態にアプローチすべく、16S rRNAやamoA遺伝子を対象としたアンプリコン配列解析や、ショットガンシーケンシングに基づくメタゲノム解析など、非培養・系統網羅的な遺伝子・ゲノム配列解析が地球規模で行われている。今日ではシーケンス技術の発展により、大量のサンプルと配列データに基づいた大規模メタゲノム解析や、新規のシーケンス技術や実験手法を組み合わせたより発展的な解析技術開発の試みも広がっている。本発表では、環境微生物のバイオインフォマティクス解析を解説し、発表者が取り組んできた土壌や雨水、海洋環境の地球微生物学研究を紹介したい。