E型肝炎ウイルス（HEV）はE型肝炎の原因ウイルスであり，本邦では遺伝子型3型と4型が検出されている。北海道では高病原性である4型が他地域よりも高率に検出されるため，われわれは3型と4型を迅速に鑑別可能なマルチプレックスreal-time RT-PCR法（鑑別PCR）を開発した。今回，遺伝子型およびHEV RNA濃度既知の献血者由来検体を対象に，リアルタイムPCR試薬であるQuantiTect Probe RT-PCR Kit（従来試薬）およびReliance One-step Multiplex RT-qPCR Supermix（BIO-RAD，A試薬）を用いて，鑑別PCRにおいて感度などに変化があるかを検討した。各遺伝子型のリニアダイナミックレンジは，3型に対しては同等で，4型に対してはA試薬が従来試薬よりも線形区間が10倍広範囲であった。PCR効率は，3型で109.9% vs. 108.3%，4型で89.7% vs. 97.1%であり，血漿1,000 μL使用時の検出感度は，3型で20 IU/mL vs. 19 IU/mL，4型で66 IU/mL vs. 16 IU/mLであった（いずれも従来試薬vs. A試薬）。A試薬により4型に対するPCR効率および検出感度は向上し，高病原性である4型の感染者において遺伝子型情報をより早期に提供可能であり，その後の治療に有用と考えられた。
