抄録
我々は高等植物のプラスチド間の分化機構に関与するタンパク質を同定するために、プラスチドプロテオーム解析を試みた。
まず、葉緑体分化に関与するタンパク質を調べるために、シロイヌナズナの核コードの葉緑体タンパク質をチラコイド内膜へ輸送するΔpH依存経路が欠損したapg2 （albino or pale green mutant 2）と葉緑体タンパク質の翻訳終結因子を欠損したapg3のプラスチドプロテオームデータを得た。野生型に比べて、葉緑体ゲノムコードタンパク質の翻訳に大きな影響が見られるapg3では葉緑体タンパク質のうち核コードタンパク質が多く推定されたのに対して、apg2は葉緑体ゲノムコードタンパク質が多く推定された。このようにapg3やapg2のプラスチドプロテオームの結果は原因遺伝子の機能とよく一致し、原因遺伝子の機能解析に有用と考えられる。
次に、葉緑体からクロモプラストへの分化に関与するタンパク質を調べるために、4つの成熟段階（Mature Green・Yellow・Orange・Red）のマイクロトム果実のプラスチドプロテオームデータを得た結果、MG果実ではATPase β subunitやendoribonuclease/protein kinase IRE1 like protein、Red果実ではplastid lipid associated proteinやlipocalinが多く蓄積していた。
