短距離古典分子動力学シミュレーションコードのGPGPU化(1)

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短距離古典分子動力学シミュレーションコードのGPGPU化(1)

中川恒

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キーワード: GPGPU, CUDA, 並列化, 短距離古典分子動力学法, 高速化, High Performance Computing

ジャーナルフリー

2017 年 19 巻 4 号 p. 267-273

DOI https://doi.org/10.11436/mssj.19.267

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抄録

本連載では短距離古典分子動力学シミュレーションコードのGPGPU 化の方法について解説する. 連載第一回目は短距離古典分子動力学シミュレーションの基本アルゴリズムについて概観したのち, ホットスポットである相互作用計算のGPGPU 実装と最適化手法について紹介する.

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© 2017 分子シミュレーション研究会

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