群発性に着目したO-型糖鎖修飾部位予測

抄録

タンパク質に対するO-型糖鎖修飾は，多様な生命現象において重要な役割 を果たしている．セリン，トレオニンに修飾することは判明しているが， そのコンセンサス配列は知られていない． アミノ酸配列上の修飾部位は群発して見られる場合とそうでない場合に二分さ れることが知られており，異なる修飾機構をもつことが予想される． 本研究では，それぞれについてSVMを構築し，修飾部位の予測を行った． その結果，二つに分けずに予測したときよりも特に群発グループにおいて 予測性能が向上した．