微生物は、水中の易分解性有機物を代謝する過程で難分解性DOM(RDOM)を副産物として生成し、その一部は腐植様蛍光性DOM(FDOM-H)として検出される。このプロセスは、微生物炭素ポンプによる水中への有機物隔離として注目されている。本研究では、微生物炭素ポンプ効率(≒FDOM-H生成効率)に対する水温、基質特性、堆積物、底生生物の影響を、琵琶湖から採取した水中有機物の長期生分解実験および表層堆積物コアの培養実験により調べた。その結果、高水温や基質中の準易分解性有機物濃度の低下がFDOM-Hの生成を促進すること、また堆積物によるFDOM-Hの水中への溶出、および底生生物添加によるその増加が観測された。これらの知見は、微生物炭素ポンプが水中および堆積物表層の環境条件に敏感に反応し、その有機物隔離機能が環境変動の影響を受けることを示唆する。