Cell-free DNAの適正保存条件に関する基礎検討―リキッドバイオプシーの標準化に向けた試み―

抄録

がん遺伝子パネル検査は次世代シーケンサーを用いたがん関連遺伝子の網羅的解析手法であり，一般的に組織検体を使用するが，血液中のcell-free DNA（以下，cfDNA）を検体とするリキッドバイオプシー（以下，LBx）が注目されている。LBxにおけるcfDNA分析では，採血から分析に至る手順の標準化が課題であり，採血管の種類や保存条件がcfDNAの品質に与える影響についての検証が求められている。健常人10名を対象に3種類の採血管（EDTA-2Na，EDTA-2K，セルフリーDNA抽出専用採血管）に採血を行い，血漿よりcfDNAを抽出後，総DNA濃度を蛍光法で測定し，−80℃で保存した。保存したcfDNAは7日以内，1カ月，3カ月，6カ月後に融解し，電気泳動によるバンドパターンを比較した。その結果，採血管の種類によって総DNA収量に有意差は認められず，−80℃での保存期間や採血管の違いによるcfDNAのバンドパターンの変化も確認されなかった。これらの結果から，EDTA採血管はセルフリーDNA抽出専用採血管の代替として使用でき，cfDNAは−80℃保存で6カ月間その品質を維持できることが示唆された。本研究は，LBxにおけるcfDNA分析手順の標準化に寄与する有益な知見を提供する。