日本乳酸菌学会誌
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総説
次世代シーケンサーデータの解析手法 第 10 回 DDBJ への塩基配列の登録(実践編)
谷澤 靖洋, 藤澤 貴智, 真島 淳, 李 慶範, 遠野 雅徳, 坂本 光央, 大熊 盛也, 中村 保一, 清水 謙多郎, 門田 幸二
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キーワード: D-way, INSDC, DDBJ, MSS, JCM
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2017 年 28 巻 2 号 p. 94-100

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抄録

多くの学術雑誌は、その論文中で決定された塩基配列を国際塩基配列データベース(International Nucleotide Sequence Database Collaboration; INSDC)に登録することを掲載の条件としている。DNA Data Bank of Japan(DDBJ)は、INSDC を構成する日米欧三極の1 つである。本稿では、DDBJ への登録用アカウントの取得から、Lactobacillus acidipiscis JCM 10692T 株のゲノム配列登録作業について解説する。ウェブサイト(R で)塩基配列解析(URL: http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~ka

dota/r_seq.html)中に本連載をまとめた項目(URL: http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp

/~kadota/r_seq.html#about_book_JSLAB)が存在する。ウェブ資料(以下、W)や関連ウェブサイトなどを効率的に活用してほしい。

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