日本乳酸菌学会誌
Online ISSN : 2186-5833
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総説
次世代シーケンサーデータの解析手法 第 12 回 Galaxy:ヒストリーとワークフロー
寺田 朋子大田 達郎清水 謙多郎門田 幸二
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キーワード: NGS, Galaxy, workflow, history
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2018 年 29 巻 2 号 p. 79-88

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抄録

Galaxy は、ウェブブラウザ上でマウスを操作して行う GUI ベースの(Linux コマンドを覚える必要のない)データ解析環境である。前回は、Galaxy の概要と公共サーバ Galaxy Main の基本的な利用法について述べた。第 12 回は、前回 Galaxy Main 上で行った解析結果(ヒストリー)の他の研究者との共有や、以前行った解析手順(ワークフロー)を他のデータに適用する手段を中心に述べる。また、ヒストリー間のデータのコピーや、自身の PC を経由しない Galaxy Main へのデータの取り込みなど、関連した便利な機能についても紹介する。今回の内容は、ウェブブラウザの違いに起因する不具合を避けるため、Google Chrome または Firefox(Internet Explorer は非推奨)を用いてほしい。ウェブサイト(R で)塩基配列解析(URL: http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r_seq.html)中に本連載をまとめた項目(URL: http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r_seq.html#about_book_JSLAB)が存在する。ウェブ資料(以下、W)や関連ウェブサイトなどを効率的に活用してほしい。

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© 2018 日本乳酸菌学会
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