抗菌剤の使用は薬剤耐性菌の選択及び腸内細菌叢の撹乱を起こす．生菌剤により抗菌剤の影響を制御することが期待されるが，有効な制御法については明らかでない．そこで今回，健康な哺乳子牛へ，抗菌剤としてセファレキシン（CEX）と生菌剤として酪酸菌（Clostridium butyricum）を異なるタイミングで投与し，薬剤耐性菌の選択及び腸内細菌叢の変化について，それぞれ培養法及び16S rRNAアンプリコンメタゲノム解析によって評価した．結果，抗菌剤に先行して生菌剤を投与したところ，抗菌剤のみを投与した場合に比べて，セファロスポリン耐性大腸菌の分離割合が低く抑えられ，腸内細菌叢の変動も抑制された．以上のことから，抗菌剤に先行して生菌剤を哺乳子牛に一定期間投与することで，薬剤耐性菌の選択が抑制され，腸内細菌叢の撹乱も緩和される可能性が示された．
