概要 全原子分子動力学（MD）シミュレーションにより大規模なタンパク質複合体のシミュレーションが可能になってきた一方で，粗視化モデルを用いたタンパク質の大規模，長時間のシミュレーションも発展してきて いる．本稿では，タンパク質間の相互作用の粗視化モデルについて紹介する．タンパク質の粗視化モデルの一つであるGōモデルを用いてタンパク質内の相互作用を表し，タンパク質間の相互作用をアミノ酸間の有効相互作用を用いてモデル化する．特に，水溶液中の疎水性アミノ酸間に働く相互作用を，全原子MD により求めた結果についてまとめる．この結果から疎水性アミノ酸間の相互作用の粗視化モデルを構築し，タンパク質複合体に適用した結果について報告する．
