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27件中 1-20の結果を表示しています
  • アミン モハマド・アルタフル, 辻  尚, 黒川  顕, 旭  弘子, 真保  陽子, 金谷 重彦
    Journal of Computer Aided Chemistry
    2006年 7 巻 150-156
    発行日: 2006年
    公開日: 2006/09/15
    ジャーナル フリー
    本研究では、いままでに開発を進めたクラスタリング・アルゴリズムに基づいて開発を進めたグラフ・クラスタリング・ソフトウエアについて報告する。本アルゴリズムは、要素間がお互いに密に連結した領域を抽出するために開発されたアルゴリズムである。ユーザーは、密な結合関係のみをクラスターとして抽出したい、あるいは疎な結合関係までを考慮に入れたいなどの目的に応じて適切な範囲内で二つのパラメータを自由に設定することができる。本ソフトウエアは一般にはグラフ・クラスタリングとして用いるが、非常に複雑なタンパク質相互作用関係からタンパク質複合体を検出することに焦点をあてることもできる。さらに、本ソフトウエアは、適切な分子機能単位を表すタンパク質のクラスターを視覚化することも可能であり、また、その他の多くのネットワークで表現されるデータから適切なクラスターを抽出することにも適用可能である。
  • 浅村 尚生
    気管支学
    1997年 19 巻 3 号 269-270
    発行日: 1997/05/25
    公開日: 2016/10/01
    ジャーナル フリー
  • TATSUO SATO, YUKIKO SATO, HISAICHI SAKUMA, KIYOSHI KOBAYASHI, YUKIO MIURA, KAORU YOSHINAGA, HIROKI WATANABE
    The Tohoku Journal of Experimental Medicine
    1975年 115 巻 3 号 263-269
    発行日: 1975年
    公開日: 2008/11/28
    ジャーナル フリー
    Three members of a kindred exhibiting bilateral adrenal pheochromocytomas are presented together with previously reported 15 familial cases in Japan. The rate of tumor growth, the stage of asymptomatic or chemical pheochromocytoma and the importance of urinary catecholamine assay for detection and diagnosis in this type of tumor are particularly emphasized.
  • 岩波 洋造
    植物学雑誌
    1962年 75 巻 886 号 133-139
    発行日: 1962年
    公開日: 2006/12/05
    ジャーナル フリー
    マツバボタンの雄ずいは, 花糸に曲げる刺激を与えると, それと反対の方向に倒れる運動を行なう. マツバボタンの花に一本だけ雄ずいを残し, これを解剖顕微鏡で観察したり, 8mmのフィルムに連続撮影をしたりして運動の速度, 方向, 刺激の与え方による変化などについて調べた.
    刺激に応じて運動を行なった直後, その雄ずいは次の刺激に対して反応を示さないが, しばらく放置しておくと, 前と同様の運動を行なうようになる. 完全に同じ運動をくり返すための刺激の間かくは, 同一方向へのときには約12分, 反対方向への運動のときには約3分である.
    刺激(花糸を曲げる角度)が大きいほど雄ずいは大きな運動を行なうが, 曲げておく時間が短いほどよく運動を行ない, 雄ずいを4秒以上曲げておいてからはなすと, 反対方向への運動を全く行なわなくなる.
    雄ずいの運動は, 花の内部, 外部に向かって行なわれるだけでなく, いずれの方向に対しも同じように倒れる運動を行なう.
  • 鶴 清, 米田 完
    日本ロボット学会誌
    2007年 25 巻 5 号 738-744
    発行日: 2007/07/15
    公開日: 2010/08/25
    ジャーナル フリー
    This paper introduces a new light weight window cleaning robot with magnetic synchronous drive wheel and up/down wiper system. A pair of indoor/outdoor units attract each other by a magnetic force. Each unit has two slanted wheels to make a straight and curbed motion. Actuators are equipped only on the indoor unit, and the outdoor unit is a totally non electric system. A wheel on the outdoor unit is driven by a remote torque through a magnetic coupling where pair of multi-pole disk magnets are faced parallel on inside and outside of the glass. A wiper system also has a magnetic coupling to transmit an up/down motion from the indoor actuator to the outdoor linkages. Some experiments show the versatile locomotion and wiping performances.
  • Makoto Sasaki, Takashi Joh, Satoshi Koikeda, Hiromi Kataoka, Satoshi Tanida, Tadayuki Oshima, Naotaka Ogasawara, Hirotaka Ohara, Haruhisa Nakao, Takeshi Kamiya
    Journal of Clinical Biochemistry and Nutrition
    2007年 41 巻 3 号 191-196
    発行日: 2007年
    公開日: 2007/10/30
    ジャーナル フリー
    The aim of this study was to evaluate the effects of oral administration of transglucosidase (TG) on postprandial glucose concentrations in healthy subjects. A randomized placebo-controlled three-way crossover trial was separated by a washout period of more than 3 days. Twenty-one normal healthy volunteers, aged 30–61 years old (17 males and 4 females) were selected for this study. The subjects’ health was assessed as normal by prestudy screening. All subjects received 3 types of test meals (3 rice balls: protein, 14.4 g; fat, 2.1 g; and carbohydrate, 111 g: total energy, 522 kcal) with 200 ml water in which 0 mg, 150 mg, or 300 mg of TG was dissolved. Blood samples for estimating plasma glucose and insulin concentrations were collected before and every 30 min after the experiment. As compared to no TG treatment, TG administration tended to prevent a postprandial increase in plasma glucose (p = 0.069: 150 mg of TG vs control) but there were no significant difference among three groups. With regard to the 17 subjects who were suggested to have impaired glucose tolerance, TG significantly decreased the postprandial blood glucose (p<0.05: 150 mg and 300 mg of TG vs control) and marginally decreased insulin concentrations (p = 0.099: 300 mg of TG vs control). These results suggest that TG may be useful for preventing the progression of type 2 diabetes mellitus.
  • 鶴 清, 米田 完
    ロボティクス・メカトロニクス講演会講演概要集
    2006年 2006 巻 1A1-D38
    発行日: 2006年
    公開日: 2017/06/19
    会議録・要旨集 フリー
    This paper shows that the progress of the new mechanism robot of cleaning while both sides of the window at same time has been advances by using the strong magnetic adhering power and torque of the multi magnetic poles type permanent magnets, to achieve to attempt further of the window cleaning robot with the rise to demand working efficiency, recently.
  • NOBORU SHINDO, MASAAKI OKADA
    ACTA HISTOCHEMICA ET CYTOCHEMICA
    1986年 19 巻 5 号 567-579
    発行日: 1986年
    公開日: 2009/10/28
    ジャーナル フリー
    This study was undertaken to reveal the correlation with immunoglobulins, complement and electron dense deposits seen by ordinary electron microscopy (EM), and to clarify whether the main site of deposition differs according to the type of immunoglobulins, using an immunoelectron microscopic (IEM) technique, with minor modification. Study cases consisted of 13 patients with various types of glomerulonephritis. Electron microscopic, and immunofluorescence (IF) examinations were performed by the standard methods. For IEM, glutaraldehyde-fixed kidney specimen was used.
    In all cases, the localization of immunoglobulins and complement seen by IEM corresponded to electron dense deposits seen by ordinary EM. By IEM on various types of glomerulonephritis, the main site of deposition differed according to the type of immunoglobulins; IgG was found in all locations, while IgA and IgM were found mainly in subendothelial and mesangial areas.
    In one case of membranous nephropathy and one case of IgA nephropathy, IgG was found to be outside of the glomerular basement membrane (GBM), while IgA was seen to be inside the GBM. The method described in this study can be used for examination of both ordinary EM and IEM using the same kidney tissue. This is important to make strict correlation between immunopathologic and histopathologic findings.
  • 鶴 清, 広瀬 茂男
    ロボティクス・メカトロニクス講演会講演概要集
    2008年 2008 巻 1A1-D20
    発行日: 2008/06/06
    公開日: 2017/06/19
    会議録・要旨集 フリー
    高所での危険な作業を人に代わって行う壁面移動ロボットの開発は活発に進んでいる。中でも,ロボットを鉄壁面に吸着しながら移動も行う吸着駆動方法の開発はブレイクスルーのひとつであり,現在,鉄製のガスタンク,原子炉壁の固定にはブロアー式と磁気吸着式が考えられるが,その内,外部に駆動系設備が要らない磁気吸着式が注目されているしかし,従来の磁気吸着式は,鉄面の溶接部,リベット部などの凹凸がある場合は吸着力が著しく減少してしまうことが壁面移動ロボットの発展の課題とされているまた,この凹凸を乗り越えて移動するロボットも研究されているが,永久磁石の強力な磁気吸着力を脱離する移動機構などを組み込んでいるため重量化して実用的でない.実用面を考慮すると人が手で持ち運びできる小型・軽量型で,溶接部やリベットなどの凹凸がある鉄板でも確実に吸着できる磁石ユニットがあると,鉄製構造物に吸着移動するロボットの吸着ユニットのとして有効である.現状で十分な吸着力がある吸着器に対する要望は依然として高いが,有効な吸着器の発表は未だない.そこで,このような課題を解決するために,永久磁石の磁気吸着力をばねの力に蓄えることで,可変位型の磁気吸着部を構成して,さらに全方向に移動可能できる磁気吸着型善方向移動ロボットの機構を組み込んだ新しい概念、のロボットの研究を進めてきたこの全容をFig.1に示す.本報告は,開発中の移動方法と構造を示す.
  • Masafumi MINOSHIMA, Kazuya KIKUCHI
    Analytical Sciences
    2015年 31 巻 4 号 287-292
    発行日: 2015/04/10
    公開日: 2015/04/10
    ジャーナル フリー
    Histone deacetylases (HDACs) enzymes are responsible for removing epigenetic markers on histone proteins, which results in chromatin inactivation and gene repression. An evaluation of HDAC activity is essential for not only determining the physiological function of HDACs, but also for developing HDAC-targeting drugs. This review focuses on the chemical tools used to detect HDAC activity. We highlight activity-based probes and positron emission tomography probes based on the chemical structure of the inhibitors. We also summarize fluorogenic probes used in single-step methods for HDAC detection. These fluorogenic probes are designed based on the nucleophilicity of the amino group, aggregation via electrostatic interactions, and changes in the DNA binding properties. These fluorogenic systems may enable facile and rapid screening to evaluate HDAC inhibitors, which will contribute to the development of epigenetic drugs.
  • -大深度・高傾斜井を用いたInside CT Walk-away DAS-VSP 実証試験-
    小林 佑輝, 成瀬 涼平, 安達 啓太, 森嶋 祐輔, 谷 昌憲, 薛 自求
    石油技術協会誌
    2019年 84 巻 1 号 17-31
    発行日: 2019/02/15
    公開日: 2022/02/03
    ジャーナル フリー

    In order to evaluate operational and geophysical feasibility of vertical seismic profile (VSP) survey using distributed acoustic sensing (DAS) for future time-lapse monitoring, we conducted a field experiment of VSP with DAS measurement (DAS-VSP) at onshore Japan. The main purposes of this field experiment are 1) to quantitatively evaluate data acquired in a deep and highly deviated well and with fiber optics deployed inside coiled tubing (CT-DAS-VSP),2) to investigate the possibility of subsurface imaging by DAS-VSP, 3) to acquire DAS-VSP data under flowing condition for future evaluation of the possibility of subsurface monitoring during fluid injection. Among several methods to install fiber optic cables, Inside CT method was adopted that we deployed a coiled tubing in which a fiber optic cable had already been inserted. VSP shot gathers with more than 800 channels with 5 m spacing were acquired at 70 source locations as a 2D walk-away VSP survey. Although data quality was of our biggest challenge, it is confirmed that not only P-wave direct arrival, but also P-P reflections and P-S converted wave were recorded with acceptable signal to noise ratio even with poor coupling condition inevitable by the optical-fiber deploying method, and even under flowing condition. The effect of gauge length, which is one of key parameters for DAS measurement, on the quality of DAS-VSP shot gather were examined with the real data during post-field data optimization. It is realized that the important parameter must be determined carefully, and that, if possible, post-field optimization using raw optical backscatter information is recommended.

  • SUKHOON JUNG, WOO-HYUK JANG, HEE-YUNG HUR
    Genome Informatics
    2008年 21 巻 77-88
    発行日: 2008年
    公開日: 2011/07/11
    ジャーナル フリー
    The increasing amount of available Protein-Protein Interaction (PPI) data enables scalable methods for the protein complex prediction. A protein complex is a group of two or more proteins formed by interactions that are stable over time, and it generally corresponds to a dense sub-graph in PPI Network (PPIN). However, dense sub-graphs correspond not only to stable protein complexes but also to sets of proteins including dynamic interactions. As a result, conventional simple PPIN based graph-theoreticlustering methods have high false positive rates in protein complex prediction. In this paper, we propose an approach to predict protein complexes based on the integration of PPI data and mutually exclusive interaction information drawn from structural interface data of protein domains. The extraction of Simultaneous Protein Interaction Cluster (SPIC) is the essence of our approach, which excludes interaction conflicts in network clusters by achieving mutually exclusion among interactions. The concept of SPIC was applied to conventional graph-theoretic clustering algorithms, MCODE and LCMA, to evaluate the density of clusters for protein complex prediction. The comparison with original graph-theoreticlustering algorithms verified the effectiveness of our approach; SPIC based methods refined false positives of original methods to be true positive complexes, without any loss of true positive predictions yielded by original methods.
  • ポストゲノムのフロントランナー
    原島 俊
    化学と生物
    2002年 40 巻 11 号 738-748
    発行日: 2002/11/25
    公開日: 2009/05/25
    ジャーナル フリー
  • 幾瀬マサ
    植物研究雑誌
    1955年 30 巻 2 号 45-55
    発行日: 1955/02/20
    公開日: 2023/04/03
    ジャーナル フリー
  • 水田 啓子
    化学と生物
    2005年 43 巻 7 号 454-460
    発行日: 2005/07/01
    公開日: 2009/05/25
    ジャーナル フリー
  • 野沢 悟
    肺癌
    1992年 32 巻 2 号 223-232
    発行日: 1992/04/20
    公開日: 2011/08/10
    ジャーナル フリー
    薬剤耐性における養子免疫療法の有用性を推測するため, 肺癌患者の胸水から肺小細胞癌細胞株 (STC1) と肺非小細胞癌細胞株 (LO301) およびそれらのシスプラチン耐性細胞株 (STC1/CDDP, LO301/CDDP) を樹立して, それらの細胞株に対する自己のリンパ球の細胞傷害性を比較検討した.MTT assayを用いた薬剤感受性試験では, STC1/CDDPは, CDDP, MMC, VCR, CPA, VP-16について耐性が認められ, LO301/CDDPは, CDDP, ADM, MMC, VCR, VP-16について耐性が認められた.IL-2加で培養した自己のリンパ球は, どちらも薬剤耐性細胞株に対して高い細胞傷害性を有していた.invitroのautologousな系を用いたこれらの結果から, 薬剤耐性を示した肺癌に対する養子免疫療法の有用性が示唆された.
  • 泉川 桂一, 石川 英明, 吉川 治孝, 礒辺 俊明, 高橋 信弘
    化学と生物
    2015年 53 巻 12 号 850-859
    発行日: 2015/11/20
    公開日: 2016/11/20
    ジャーナル フリー
    生体内ではRNAとタンパク質は,お互いに相互作用し合いRNA–タンパク質複合体としてさまざまな生理機能を発揮する.その際,タンパク質が翻訳後修飾でその機能が制御されているのと同様に,RNAは転写後修飾によって機能が制御されている.RNAにも100種類を超える転写後修飾が知られ,RNAの生体内での真の機能をこれらの修飾情報を知ることなく理解することはできない.ここに,RNA–タンパク質複合体のトータル解析の必要性がある.本稿では,最近開発された質量分析法とゲノムワイドな検索エンジンを基礎とした直接的なRNA解析法を紹介し,プロテオミクスの手法によるタンパク質の直接解析法と合わせたRNA–タンパク質複合体のトータル解析について概説する.
  • 日野 光紀, 小林 国彦, 林原 賢治, 仁井谷 久暢
    日本臨床免疫学会会誌
    1990年 13 巻 6 号 593-602
    発行日: 1990/12/31
    公開日: 2009/01/22
    ジャーナル フリー
    LAK細胞の殺細胞効果に及ぼす抗癌剤の影響にっき, Hman tumor cell clonogenic assayを用いて検討した. K562細胞を抗癌剤に暴露した後,播種した場合のコロニー抑制率に比べて,抗癌剤暴露後,ただちにLAK細胞と接触させ播種した場合のコロニー抑制率は有意に増強されていた.その抗癌剤とLAK細胞の併用による殺細胞効果は相加効果に一致していた.また, LAK細胞の標的細胞に対する殺細胞効果は抗癌剤が同時に存在していても影響を受けることはなかった.さらにシスプラチン,マイトマイシンを暴露することによって作製された抗癌剤抵抗性K562細胞に対するLAK細胞のコロニー抑制効果は,親細胞であるK562細胞に対するコロニー抑制効果より有意に増強する効果が得られた.その殺細胞効果の増強について, LAK細胞の標的細胞に対する認識.結合の点からK562細胞とCDDP抵抗性K562細胞の違いをdirect conjugate forming assayおよびcold target inhibition assayによって検討した.その結果, CDDP抵抗性細胞に対するLAK細胞の認識・結合は低下していた.さらにnon-ionic detargentであるNP-40を用いて2つの細胞の膜の脆弱性につき検討を加えた.それよりCDDP抵抗性細胞の抵抗性化に伴う細胞膜の脆弱化が示唆され, LAK細胞による殺細胞効果の増強の一因と考えられた.
  • 小林 佑輝, 成瀬 涼平, 薛 自求
    物理探査
    2018年 71 巻 56-70
    発行日: 2018年
    公開日: 2018/09/20
    ジャーナル フリー

    近年の技術進歩により,坑内に展開した光ファイバーをジオフォンの代わりとして使用するDistributed Acoustic Sensing(DAS)計測が注目されており,将来の低コストでの長期モニタリングのツールとして大いに期待されている。二酸化炭素地中貯留技術研究組合は,2017年8月に,大深度および傾斜井で,かつ,コイルドチュービング内に展開した光ファイバーを用いてのDAS-Vertical Seismic Profile(VSP)記録の評価を目的に,国内陸域の坑井においてDAS-VSP現場実証試験を実施した。貴重なDAS計測の機会を活用し,人工震源での発震作業を行えない夜間には,バックグラウンドノイズデータ取得のため連続DAS計測を行った。計12時間の連続計測期間中,通常のバックグラウンドノイズとは明らかに異なるイベントを観測した。同イベントと他のノイズイベントとの比較から,同イベントが自然地震によるものであると結論付けられた。気象庁解析結果と比較したところ,8月27日4:15(Japan Standard Time) に調査井からの震源距離約16 kmで発生したマグニチュード2.3の地震と同定できた。周辺のHi-net観測点波形データの解析結果と比較し,本調査期間中にDAS計測の検出感度を超えていた地震は上記地震のみであると考えられる。DAS計測を用いた地震観測には依然克服されるべき課題が多いものの,従来のジオフォンによる坑内観測と比較しメリットが多い同手法による長期地震観測の可能性が示された。

  • Naoshi Fukuhara, Nobuhiro Go, Takeshi Kawabata
    BIOPHYSICS
    2007年 3 巻 13-26
    発行日: 2007年
    公開日: 2007/07/07
    ジャーナル フリー
    Protein-protein interactions support most biological processes, and it is important to find specifically interacting partner proteins among homologous proteins in order to elucidate cellular functions such as signal transduction systems. Various high-throughput experimental methods for identifying these interactions have been invented, and used to generate a huge amount of data. Because these experiments have been applied to only a few organisms, and their accuracy is believed to be limited, it would be valuable to develop computational methods for predicting protein-protein interactions from their amino acid sequences or tertiary structural information. In this study, we describe a prediction method of interacting proteins based on homology-modeled complex structures. We employed the statistical residue-residue contact energy used in a previous study, and two types of new scores, simple electrostatic energy and sequence similarity between target sequences and template structures. The validity of each protein-protein complex model was measured using their single and combined scores. We applied our method to all the protein heterodimers of Saccharomyces cerevisiae. To evaluate the prediction performance of our method, we prepared two types of protein-protein interaction dataset: a complete dataset and high confidence dataset. The complete dataset (10,325 protein dimer models) contains all the yeast protein heterodimers whose complex structures can be modeled. Among them, pairs registered in the DIP database are defined as interacting pairs, and those not registered are defined as non-interacting protein pairs. The high confidence dataset (3,219 protein dimer models) is a more reliable subset of the complete dataset extracted using the criteria of the common subcellular localization. Both datasets show that sequence similarity has a much higher discrimination power than the other structure-based scores, but that the inclusion of contact energy results in significant improvement over predictions using sequence similarity alone. These results suggest that the sequence similarity is indispensable for the prediction, whereas structure scores can play supporting roles.
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