secA1遺伝子を用いたnontuberculous mycobacteria（非結核性抗酸菌）の同定

抄録

分子生物学的手法の普及によりMycobacteriumは5属に再編成され，菌種も188種以上に増加した。そのため，従来の遺伝子検査やフェノタイプ検査では，非結核性抗酸菌の同定が困難になっている。そこで，ハウスキーピング遺伝子の一つであるsecA1遺伝子を用いた，系統樹解析やBLAST解析で同定を試みた。その結果，DDH法や16S rRNA遺伝子では同定困難であったM. abscessus，M. avium，M. fortuitum，M. lentiflavum，M. mageritense，M. marseillense，M. ulceransの同定が可能であった。secA1遺伝子はM. intracellulareなどの鑑別に課題は残るが，GenBankに登録された基準・標準株が増加したことにより，非結核性抗酸菌の同定ツールとしての有用性が増した。