土木学会論文集G(環境)
Online ISSN : 2185-6648
ISSN-L : 2185-6648
環境工学研究論文集 第55巻
細菌捕食性原生動物の18S rRNA遺伝子を標的としたユニバーサルPCRプライマーの設計と適用
中村 寛治奥田 春香
著者情報
ジャーナル フリー

2018 年 74 巻 7 号 p. III_239-III_245

詳細
抄録
 細菌捕食性原生動物の18S rRNA遺伝子を標的としたqPCR用のユニバーサルプライマーを設計し,その有効性を検討した.18S rRNA遺伝子検出用のプライマーは,過去の18S rRNA遺伝子の塩基配列解析結果を基に,コンセンサス配列の部分を決定した上で設計した.18S rRNA遺伝子の開始点から 約500 basesの領域と約1000 basesの領域から,異なる2種類のqPCR用のプライマーペアを設計した.これら2種類のプライマーペアを使って,広瀬川河川水から抽出したDNAを対象にqPCRを行った.その結果,それぞれの18SrRNA遺伝子数の値が極めて近くなり,測定値は妥当であることが示唆された.また,16S rRNA遺伝子数も測定し,関連性を解析した結果,一定の範囲で比例関係にあることが分かった.
著者関連情報
© 2018 公益社団法人 土木学会
前の記事 次の記事
feedback
Top