2011 年3 月11 日の東日本大震災とそれに続く津波による冷却機能の喪失により，東京電力福島第一原子力発電所 （FDNPP）が損傷し，放射能漏れ事故が発生した．農研機構は震災翌日の3 月12 日に付属農場の原乳を採取し，放射能漏れ事故直前の原乳中γ線核種濃度を得た．牛乳放射能の緊急時調査は3 月15 日18 時に採取した原乳から開始した．原乳中の131I 濃度は155.2 Bq/L，3 月23 日には最高値の244.8 Bq/L に達した後，徐々に低下し，2011 年5 月26 日には下限検出値まで低下した．一方，放射性セシウムの汚染レベルは，131I よりも遅れて上昇した．すなわち，3 月15 日に1.87 Bq/L の134Cs および2.24 Bq/L の137Cs を検出したが，3 月20 日まで濃度は顕著に上昇しなかった．3 月21 日には134Cs と Cs の合計値として10 Bq/L を超えるレベルで検出され，その後，3 ヶ月間に渡って，134Cs+137Cs の濃度は10 Bq/L 以上 を維持した．一方，乳中の90Sr 濃度はFDNPP の事故後も増加せず，事故前から10 ～30 mBq/L を維持していた．2011 年から開始した混合飼料（TMR）中の放射性セシウム濃度調査では，134Cs および137Cs 濃度の最高値は，2012 年11 月の7.78 Bq/kg（乾物）および13.44 Bq/kg（乾物）で，2011 年よりも2012 年の測定値が高かった．放射性セシウム濃度（134Cs+137Cs） は，原乳では0.2 Bq/L，TMR では2 Bq/kg（乾物）程度まで低下した後，横ばいで推移している．
